今年的中冠聯賽參賽球隊的數量明顯增多，參加抽簽的70支球隊分為南、北9個賽區，分別是云南曲靖、貴州興義、廣東吳川、廣東三水、江西定南、寧夏銀川、陜西榆林、內蒙古包頭和山東日照賽區。
3月17日晚， 2025賽季中冠聯賽大區賽抽簽儀式在廣東佛山三水區舉行。經過現場嘉賓和參會代表抽簽，參加今年中冠聯賽的70支球隊分別落位在南、北9個賽區。
2025賽季中冠聯賽大區賽和決賽階段的競賽辦法與以往有所改變。大區賽為集中賽會制，先采取分組單循環賽制，共分9個賽區、18個小組，每組3-4支隊伍。每兩個小組在一個賽區。大區賽同賽區兩個小組的第一名和第二名共4支球隊組成晉級組，進行兩輪單循環賽（同組的兩隊不再進行比賽）；晉級組結束后，排名只計算四隊間的比賽成績。各賽區第一名直接進入總決賽，成績最好5個第二名直接進入總決賽，其他4個第二名，進行主客場附加賽，產生最后兩個晉級名額。通過各賽區晉級組比賽和附加賽共計產生16支晉級總決賽球隊。
今年的中冠聯賽升級名額比以往競爭更為激烈，變為3.5個名額，中冠聯賽的第四名將與U21聯賽冠軍打附加賽，競爭一個升中乙的名額。
